Bloodstream infections and antibiotic resistance at a regional hospital, Colombia, 2019-2021 / Infecciones del torrente sanguíneo y resistencia a los antibióticos en un hospital regional en Colombia, 2019-2021 / Infecções de corrente sanguínea e resistência a antibióticos em um hospital regional, Colômbia, 2019-2021

ABSTRACT Objectives. To assess antibiotic susceptibility of World Health Organization (WHO) priority bacteria (Acinetobacter baumannii, Escherichia coli, Klebsiella pneumoniae, Salmonella spp., Staphylococcus aureus, and Streptococcus pneumoniae) in blood cultures at the Orinoquía regional hospital in Colombia. Methods. This was cross-sectional study using routine laboratory data for the period 2019-2021. Data on blood samples from patients suspected of a bloodstream infection were examined. We determined: the total number of blood cultures done and the proportion with culture yield; the characteristics of patients with priority bacteria; and the type of bacteria isolated and antibiotic resistance patterns. Results. Of 25 469 blood cultures done, 1628 (6%) yielded bacteria; 774 (48%) of these bacteria were WHO priority pathogens. Most of the priority bacteria isolated (558; 72%) were gram-negative and 216 (28%) were gram-positive organisms. Most patients with priority bacteria (666; 86%) were hospitalized in wards other than the intensive care unit, 427 (55%) were male, and 321 (42%) were ≥ 60 years of age. Of the 216 gram-positive bacteria isolated, 205 (95%) were Staphylococcus aureus. Of the 558 gram-negative priority bacteria isolated, the three most common were Escherichia coli (34%), Klebsiella pneumoniae (28%), and Acinetobacter baumannii (20%). The highest resistance of Staphylococcus aureus was to oxacillin (41%). For gram-negative bacteria, resistance to antibiotics ranged from 4% (amikacin) to 72% (ampicillin). Conclusions. Bacterial yield from blood cultures was low and could be improved. WHO priority bacteria were found in all hospital wards. This calls for rigorous infection prevention and control standards and continued surveillance of antibiotic resistance.

RESUMEN Objetivos. Evaluar la sensibilidad a los antibióticos de las bacterias incluidas en la lista prioritaria de la Organización Mundial de la Salud (OMS) (Acinetobacter baumannii, Escherichia coli, Klebsiella pneumoniae, Salmonella spp., Staphylococcus aureus y Streptococcus pneumoniae) en hemocultivos en el Hospital Regional de la Orinoquía en Colombia. Métodos. Se trata de un estudio transversal que empleó datos rutinarios de laboratorio del período comprendido entre los años 2019 y 2021. Se examinaron datos de muestras de sangre de pacientes con presunción clínica de infección del torrente sanguíneo. Se determinó el número total de hemocultivos realizados y la proporción cultivos con resultados, las características de los pacientes con bacterias prioritarias, así como el tipo de bacterias aisladas y los patrones de resistencia a los antibióticos. Resultados. De 25 469 hemocultivos realizados, se aislaron bacterias en 1628 (6%); 774 (48%) con agentes patógenos prioritarios de la OMS. La mayoría de las cepas bacterianas prioritarias aisladas (558; 72%) eran gramnegativas y 216 (28%), organismos grampositivos. La mayoría de los pacientes con bacterias prioritarias (666; 86%) fueron hospitalizados en salas distintas de la unidad de cuidados intensivos, 427 (55%) eran varones y 321 (42%) tenían 60 años o más. De las 216 bacterias grampositivas aisladas, 205 (95%) eran Staphylococcus aureus. De las 558 bacterias prioritarias gramnegativas aisladas, las tres más comunes fueron Escherichia coli (34%), Klebsiella pneumoniae (28%) y Acinetobacter baumannii (20%). La mayor resistencia de Staphylococcus aureus fue a la oxacilina (41%). Entre las bacterias gramnegativas, la resistencia a los antibióticos varió del 4% (amikacina) al 72% (ampicilina). Conclusiones. El aislamiento de bacterias en los hemocultivos fue bajo y podría mejorarse. Se encontraron bacterias de la lista prioritaria de la OMS en todas las salas del hospital, por lo que es necesario aplicar rigurosas normas de prevención y control de infecciones y realizar una vigilancia continua de la resistencia a los antibióticos.

RESUMO Objetivos. Avaliar a suscetibilidade a antibióticos das bactérias consideradas prioritárias pela Organização Mundial da Saúde (OMS) (Acinetobacter baumannii, Escherichia coli, Klebsiella pneumoniae, Salmonella spp., Staphylococcus aureus e Streptococcus pneumoniae) em hemoculturas coletadas no hospital regional de Orinoquía na Colômbia. Métodos. Estudo transversal utilizando dados laboratoriais de rotina do período 2019-2021. Foram examinados os dados de amostras de sangue de pacientes com suspeita de infecção de corrente sanguínea. Determinamos o número total de hemoculturas realizadas e a proporção de culturas com rendimento, as características dos pacientes com bactérias prioritárias, e o tipo de bactéria isolada e padrões de resistência a antibióticos. Resultados. Das 25.469 hemoculturas realizadas, 1.628 (6%) foram positivas para bactérias, sendo que 774 (48%) dessas bactérias eram da lista de agentes patogênicos prioritários da OMS. A maioria das bactérias prioritárias isoladas (558; 72%) eram gram-negativas e 216 (28%) eram gram-positivas. A maioria dos pacientes com bactérias prioritárias (666; 86%) estava internada em enfermaria, e não em unidade de terapia intensiva. 427 (55%) eram homens e 321 (42%) tinham ≥ 60 anos de idade. Das 216 bactérias gram-positivas isoladas, 205 (95%) eram Staphylococcus aureus. Das 558 bactérias gram-negativas prioritárias isoladas, as três mais frequentes foram Escherichia coli (34%), Klebsiella pneumoniae (28%) e Acinetobacter baumannii (20%). O Staphylococcus aureus apresentou maior resistência à oxacilina (41%). Entre as bactérias gram-negativas, a resistência aos antibióticos variou entre 4% (amicacina) e 72% (ampicilina). Conclusões. O rendimento bacteriano das hemoculturas foi baixo e pode ser melhorado. As bactérias consideradas prioritárias pela OMS foram encontradas em todas as enfermarias do hospital. Os achados exigem normas rigorosas de prevenção e controle de infecção, e vigilância contínua da resistência bacteriana a antibióticos.

Nivel de conocimiento sobre la extracción de hemocultivos en enfermeras de la Unidad de Cuidados Intensivos / Level of Knowledge about Blood Culture Extractions in Intensive Care Unit Nurses

Introducción: El hemocultivo es una prueba sencilla, pero existe el riesgo de contaminación por un inadecuado procedimiento, en muchas ocasiones puede estar relacionado con la mala praxis del personal de enfermería. Objetivo: Valorar el nivel de conocimientos sobre la técnica de extracción de hemocultivo en enfermeras de una Unidad de Cuidados Intensivos. Métodos: Se realizó estudio descriptivo, transversal, en la Unidad de Cuidados Intensivos del Centro Nacional de Cirugía de Mínimo Acceso, La Habana, en enero 2021. La población estuvo conformada por 12 licenciadas en enfermería, se aplicó un cuestionario de conocimiento con la escala de puntuación: 0-30 puntos (no conocimiento); 31-60 puntos (poco conocimiento); 61-90 puntos (adecuado conocimiento), 91-100 puntos (excelente conocimiento). Se calcularon las frecuencias absolutas, porcentaje, prueba T para una muestra y chi cuadrado. Se utilizó el programa IBM SPSS versión 20 para Windows. Resultados: De la muestra estudiada, 41,70 por ciento consideró que el hemocultivo se realiza a pacientes febriles y el uso de guantes estériles como único medio de protección; 33,30 por ciento hizo referencia al alcohol como antiséptico cutáneo de elección; 58,30 % planteó que se inoculan con diez ml de sangre y 66,70 por ciento afirmó que se debe comenzar por el aeróbico. El promedio de puntuación general fue de 64,25. Conclusiones: Los profesionales de enfermería mostraron un adecuado conocimiento, los guantes estériles fueron el medio de protección más utilizado, destaca el uso de alcohol 76 por ciento para la desinfección de la piel, diez mililitros es el volumen de sangre considerado a inocular en los frascos, existe adherencia a los protocolos de transporte y conservación de la muestra(AU)

Introduction: Blood culture is a simple test, but there is a risk of contamination due to an inadequate procedure, which many times can be related to malpractice of the nursing personnel. Objective: To assess the level of knowledge about the blood culture extraction technique in nurses of an intensive care unit. Methods: A descriptive and cross-sectional study was carried out in the intensive care unit of the National Center for Minimal Access Surgery, Havana, in January 2021. The population consisted of twelve registered nurses. A knowledge questionnaire was applied, which included the following scoring scale: 0-30 points (no knowledge), 31-60 points (little knowledge), 61-90 points (adequate knowledge), 91-100 points (excellent knowledge). Absolute frequencies, percentage, T-test for one sample and chi-square were calculated. The program IBM SPSS (version 20) for Windows was used. Results: Of the sample studied, 41.70 percent considered that blood culture is performed on febrile patients and the use of sterile gloves as the only means of protection. 33.30 percent referred alcohol as the skin antiseptic of choice. 58.30 percent stated that test tube or flask inoculation is completed with 10 mL of blood. 66.70 percent stated that the technique should start with the aerobic. The average overall score was 64.25. Conclusions: Nursing professionals showed adequate knowledge. Sterile gloves were the most used means of protection. The use of 76 percent-alcohol for skin disinfection is relevant. The volume of blood to empty into the flask or sample tube is 10 mL. The protocols for sample preservation and transport are followed(AU)

Variedades de cultivo de líquido amniótico para el diagnóstico in vitro de poliploidías / Amniotic fluid culture varietys for poliploydies in vitro diagnosis

RESUMEN Fundamento: El cultivo celular permite el análisis directo de las células vivas mediante un microscopio. El estudio de las células contenidas en el líquido amniótico, mediante técnicas de cultivo, detecta anomalías en número y morfología de los cromosomas, que pueden relacionarse con enfermedades genéticas. Objetivo: Caracterizar las variedades de cultivo de líquido amniótico para el diagnóstico in vitro de poliploidías. Metodología: Se realizó un estudio descriptivo transversal, en el Centro Provincial de Genética Médica de Camagüey, en el periodo de noviembre de 2016 a abril de 2018.La población de estudio estuvo constituida por 1571 muestras útiles de líquido amniótico obtenidas por amniocentesis, en gestantes en el segundo trimestre, evaluadas en consulta multidisciplinaria con criterios clínicos de estudios cromosómicos según lo establecido en el diagnóstico prenatal citogenético, previo consentimiento informado. Se utilizaron 20 mL de líquido amniótico para la siembra de células fetales, y se aplicaron tres variantes de cultivo abierto (directo, centrifugado y expandido). Se determinó el complemento cromosómico en cada variedad. Resultados: Predominó el complemento cromosómico normal. Las tetraploidías prevalecieron en el cultivo expandido. El índice mitótico fue similar en las tres variedades de cultivo y el cultivo directo tuvo el más bajo índice de poliploidías. Conclusiones: El cariotipo normal fue predominante. Las tetrapolidías fueron las alteraciones más frecuentes y prevalecieron en el cultivo expandido. En el cultivo directo se presentó el más bajo índice de errores inducidos in vitro.

ABSTRACT Background: Cell culture allows direct analysis of live cells under a microscope. The cell study contained in amniotic fluid, by culture techniques, detects abnormalities in chromosome number and morphology, which can be related to genetic diseases. Objective: To describe amniotic fluid culture strains for the in vitro diagnosis of polyploidy. Methodology: A cross-sectional descriptive study was conducted at the Camagüey Provincial Center of Medical Genetics, from November 2016 to April 2018.The study population consisted of 1571 useful amniotic fluid samples obtained by amniocentesis, in pregnant women in the second trimester, evaluated by multidisciplinary discussion with clinical criteria for chromosomal studies as established in the cytogenetic prenatal diagnosis, prior informed consent. 20 mL of amniotic fluid were used for fetal cell seeding, and three open culture strains (direct, centrifuged and expanded) were applied. Chromosomal complement was determined in each variety. Results: Normal chromosome complement was predominant. Tetraploidy prevailed in the expanded culture. The mitotic index was similar in the three culture strains and the direct culture had the lowest polyploidy index. Conclusions: Normal karyotype was predominant. Tetraploidy were the most frequent modifications and prevailed in the expanded culture. Direct culture had the lowest rate of the in vitro induced errors.

Identification and characterization of bacterial biofilm production in clinical isolates of Staphylococcus spp. against antimicrobials / Identificação e caracterização da produção de biofilme bacteriano em isolados clínicos de Staphylococcus spp. frente aos antimicrobianos / Identificación y caracterización de la producción de biopelículas bacterianas en aislamientos clínicos de Staphylococcus spp. contra los antimicrobianos

Justification and Objectives: Circulating blood is sterile and the presence of microorganisms can be of clinical interest, especially in the hospital environment, being able to cause infectious processes and substantially increase morbidity and mortality. The objective of this work was to characterize the isolates of the genus Staphylococcus spp. from bloodstream infections as to the production of bacterial biofilm and resistance to the main antimicrobials used in clinical practice. Methods: Blood cultures were collected with an indication of positivity for bacterial growth from multiple sectors of the study hospital, which were subsequently processed to identify the bacterial genus through the use of phenotypic tests for Gram positive bacteria. The verification of the resistance profile was performed following the Kirby-Bauer disk diffusion. The identification of the production and quantification of the bacterial biofilm occurred following the protocol described by O'toole (2010). Results: The most frequent clinical isolate was Coagulase negative Staphylococci 38 (54.29%), followed by Staphylococcus aureus 32 (45.71%). Resistance to erythromycin, norfloxacin, levofloxacin and azithromycin was observed in most isolates (70%). Regarding methicillin, more MRSA (59.38%) than MR-CONS (47.37%) were isolated. The ICU was the place where the formation of the biofilm showed indicative data of greater adherence, which was associated with MRSA strains. Conclusion: The bacterial isolates associated with bloodstream infections showed high resistance to antimicrobials. The presence of MRSA and MR-CONS with strong and/or moderate biofilm production capacity represents a greater risk to the health of patients affected by infections caused by these agents.(AU)

Justificativa e Objetivos: O sangue circulante é estéril e a presença de microrganismos pode ter interesse clínico, especialmente no ambiente hospitalar, sendo capaz de causar processos infecciosos e aumentar substancialmente a morbimortalidade. O objetivo deste trabalho foi caracterizar os isolados do gênero Staphylococcus spp. oriundos de infecções de corrente sanguínea quanto à produção de biofilme bacteriano e resistência aos principais antimicrobianos utilizados na prática clínica. Métodos: Foram coletadas hemoculturas com indicação de positividade para o crescimento bacteriano de múltiplos setores do hospital de estudo, as quais posteriormente foram processadas para identificação do gênero bacteriano através da utilização de testes fenotípicos para bactérias Gram positivas. A verificação do perfil de resistência foi realizada seguindo a metodologia de disco difusão de Kirby-Bauer. A identificação da produção e quantificação do biofilme bacteriano ocorreu seguindo o protocolo descrito por O'toole (2010). Resultados: O isolado clínico mais frequente foi o Staphylococcus coagulase negativo 38 (54,29%), seguido pelo Staphylococcus aureus 32 (45,71%). A resistência à eritromicina, norfloxacina, levofloxacina e azitromicina foi observada na maioria dos isolados (70%). Em relação à meticilina, foram isolados mais Staphylococcus aureus resistente à meticilina (MRSA) (59,38%) que Staphylococcus coagulase negativa resistente à meticilina (MR-CONS) (47,37%). A UTI foi o local onde a formação do biofilme apresentou dados indicativos de maior aderência, sendo essa associada às cepas MRSA. Conclusão: Os isolados bacterianos associados às infecções da corrente sanguínea apresentaram elevada resistência aos antimicrobianos. A presença de MRSA e MR-CONS com forte e/ou moderada capacidade de produção de biofilme representa maior risco à saúde dos pacientes acometidos por infecções causadas por estes agentes.(AU)

Justificación y objetivos: la sangre circulante es estéril y la presencia de microorganismos puede ser de interés clínico, especialmente en el entorno hospitalario, ya que puede causar procesos infecciosos y aumentar sustancialmente la morbilidad y la mortalidad. El objetivo de este trabajo fue caracterizar los aislamientos del género Staphylococcus spp. de infecciones del torrente sanguíneo en cuanto a la producción de biopelículas bacterianas y la resistencia a los principales antimicrobianos utilizados en la práctica clínica. Métodos: Se recogieron hemocultivos con una indicación de positividad para el crecimiento bacteriano de múltiples sectores del hospital de estudio, que posteriormente se procesaron para identificar el género bacteriano mediante el uso de pruebas fenotípicas para bacterias Gram positivas. La verificación del perfil de resistencia se realizó siguiendo la metodología de difusión de disco de Kirby-Bauer. La identificación de la producción y cuantificación de la biopelícula bacteriana se produjo siguiendo el protocolo descrito por O'toole (2010). Resultados: El aislado clínico más frecuente fue Staphylococcus coagulasa negativo 38 (54.29%), seguido de Staphylococcus aureus 32 (45.71%). Se observó resistencia a la eritromicina, norfloxacina, levofloxacina y azitromicina en la mayoría de los aislamientos (70%). Con respecto a la meticilina, se aislaron más MRSA (59,38%) que MR-CONS (47,37%). La UCI fue el lugar donde la formación de la biopelícula mostró datos indicativos de una mayor adherencia, que se asoció con las cepas de MRSA. Conclusión: los aislamientos bacterianos asociados con infecciones del torrente sanguíneo mostraron una alta resistencia a los antimicrobianos. La presencia de MRSA y MR-CONS con una capacidad de producción de biopelículas fuerte y / o moderada representa un mayor riesgo para la salud de los pacientes afectados por infecciones causadas por estos agentes.(AU)

Correlation between findings in magnetic resonance and biopsy in the diagnosis of spondylodiscitis / Correlação entre achados na ressonância magnética e a biópsia no diagnóstico de espondilodiscite / Correlación entre hallazgos en la resonancia magnética y la biopsia en el diagnóstico de espondilodiscitis

ABSTRACT Objective To correlate magnetic resonance imaging (MRI) findings with the microbiological and anatomopathological diagnosis of spinal infection. Methods A retrospective, cohort review of online medical records (laboratory, anatomopathology and diagnostic imaging sector) of patients diagnosed with spondylodiscitis, who underwent a full spine MR scan between January 2014 and July 2018 at the Department of Orthopedics and Traumatology of the Universidade Federal de São Paulo. Results Staphylococcus aureus was the most commonly found etiological agent (57%). Blood culture was positive in 76% of cases and 82% of the patients who underwent biopsy had a spondylodiscitis diagnosis. Pain was the most prevalent clinical symptom and the lumbosacral spine was the most frequent site of infection. T1 hyposignal, T2/STIR hypersignal, and terminal plate destruction were verified in almost all MR scans. Conclusions No direct correlation was found between MR findings and any specific etiological agent. Blood culture and biopsy are important diagnostic tools that should be used for accurate diagnosis of the infectious agent . Level of evidence IV; Diagnostic Study.

RESUMO Objetivo Correlacionar os achados de ressonância magnética (RNM) com o diagnóstico microbiológico e anatomopatológico de infecção na coluna vertebral. Métodos Estudo de coorte retrospectivo de revisão de prontuários online (laboratório, anatomopatológico e setor de diagnóstico por imagem) de pacientes com diagnóstico de espondilodiscite, submetidos ao exame de RNM da coluna vertebral e acompanhados pelo Departamento de Ortopedia e Traumatologia da Universidade Federal de São Paulo, entre janeiro de 2014 e julho de 2018. Resultados O agente etiológico mais comum encontrado foi o S. aureus (57%). A hemocultura mostrou-se positiva em 76% dos casos e 82% dos pacientes submetidos à biópsia apresentaram diagnóstico de espondilodiscite. A dor foi o achado clínico mais prevalente e a coluna lombossacra foi o sítio mais frequente de infecção. No exame de RNM, a presença de hipossinal em T1, hipersinal em T2/STIR e destruição das placas terminais foram identificados em quase todos os casos. Conclusões Não houve correlação direta dos achados na RNM com um agente etiológico específico na espondilodiscite. A hemocultura e a biópsia são ferramentas diagnósticas importantes que devem ser utilizadas para o diagnóstico preciso do agente infeccioso. Nível de evidência IV; Estudo diagnóstico.

RESUMEN Objetivo Correlacionar los hallazgos de resonancia magnética (RNM) con el diagnóstico microbiológico y anatomopatológico de infección de la columna vertebral. Métodos Un estudio de cohorte retrospectivo de revisión de prontuarios en línea (laboratorio, anatomopatológico y sector de diagnóstico por imagen) de pacientes con diagnóstico de espondilodiscitis, sometidos al examen de RNM de la columna vertebral y acompañados por el Departamento de Ortopedia y Traumatología de la Universidad Federal de São Paulo, entre enero de 2014 y julio de 2018. Resultados El agente etiológico más común encontrado fue el S. aureus (57%). El hemocultivo se mostró positivo en 76% de los casos y 82% de los pacientes sometidos a biopsia presentaron diagnóstico de espondilodiscitis. El dolor fue el hallazgo clínico más prevalente y la columna lumbosacra fue el sitio más frecuente de infección. En el examen de RNM, la presencia de hiposeñal en T1, hiperseñal en T2/STIR y destrucción de las placas terminales fueron identificadas en casi todos los casos. Conclusiones No hubo correlación directa de los hallazgos de la RNM con un agente etiológico específico en la espondilodiscitis. El hemocultivo y la biopsia son herramientas diagnósticas importantes, que deben ser utilizadas para el diagnóstico preciso del agente infeccioso. Nivel de evidencia IV; Estudio Diagnóstico.

Hemocultivos en el Servicio de Pediatría del Instituto Oncológico Nacional "Dr. Juan Tanca Marengo", Solca-Guayaquil / Blood cultures in the Pediatric Service of the "Dr. Juan Tanca Marengo", National Oncology Institute of Solca-Guayaquil

Introducción: La creciente resistencia antibiótica de los microorganismos aislados en cultivos de sangre en pacientes neutropénicos hace necesaria la continua monitorización del antibiograma para vigilar la cambiante susceptibilidad antibiótica. El objetivo de este estudio fue identificar a los microorganismos aislados de hemocultivos y su sensibilidad, en niños con cáncer ingresados en un Instituto Oncológico. Métodos: El presente es un estudio prospectivo de datos recolectados de junio 2017 a junio 2018, con aislamiento de cultivos de sangre en pacientes neutropénicos febriles hospitalizados en el área de pediatría del Instituto Oncológico Nacional "Dr. Juan Tanca Marengo" Solca, Guayaquil. Resultados: Fueron 183 pacientes, 133 (72 %) con neoplasias hematológicas y 50 (28 %) con tumores sólidos. Se tomaron 265 hemocultivos. 100 reportes (38 %) fueron positivos, 66 % fueron bacterias Gram-Positivas y 34 % Gram- negativas. Las bacterias más frecuentes 20 % E. epidermidis, 18 % E. aureus, 17 % E. haemolyticus, 12 % E. Coli. Las bacterias Gram-positivas fueron 100% sensibles al linezolid, vancomicina y tigacilina. Las Gram-negativas mantienen una sensibilidad de 91% a la amikacina, 59% a cefepime, 59% a ceftazidima, 77% a ciprofloxacina, 68% a imipenem, 76 % a meropenem, 56% a piperacilina- tazobactam, 100% al colistin y 97% a la tigeciclina. La Klebsiella Pneumoniae productora de Carbapenemasa (KPC) multirresistente fue sensible 100% a tigaciclina y colistin y 50% a la amikacina. Conclusión: La incidencia fue mayor para Gram- positivos. Existe una buena sensibilidad a la vancomicina, linezolid y tigaciclina para bacterias Gram- positivas; y a la amikacina, colistin y tigacilina para las Gram- negativas. Las bacterias KPC multiresistentes fueron solamente sensibles a tigeciclina y colistin.

Introduction: The increasing antibiotic resistance of isolated microorganisms in blood cultures in neutropenic patients makes it necessary to continuously monitor the antibiogram to monitor the changing antibiotic susceptibility. The objective of this study was to identify during one year the isolated microorganisms of blood cultures and their sensitivity, in children with cancer admitted to an Oncological Institute. Methods: This is a prospective study of data collected from June 2017 to June 2018, with isolation of blood cultures in febrile neutropenic patients hospitalized in the pediatric area of the National Oncology Institute "Dr. Juan Tanca Marengo "Solca, Guayaquil. Results: There were 183 patients, 133 (72%) with hematological malignancies and 50 (28%) with solid tumors. In this group 265 blood cultures were taken. 100 reports (38%) were positive, 66% were Gram-Positive bacteria and 34% Gram-negative. The most frequent bacteria 20% E. epidermidis, 18% E. aureus, 17% E. haemolyticus, 12% E. Coli, 10% Staphylococcus hominis, 9% Klebsiella Pneumoniae, 6% Pseudomona species, 5% Acinetobacter, Gram bacteria -positives were 100% sensitive to linezolid, vancomycin and tigacillin; while Gram-negatives maintain a sensitivity of 91% to amikacin, 59% to cefepime, 59% to ceftazidime, 77% to ciprofloxacin, 68% to imipenem, 76% to meropenem, 56% to piperacillin-tazobactam, 100% at colistin and 97% at tigecycline. An increase in multi-resistant Carbapenemase-producing Klebsiella Pneumoniae (KPC) was observed, 100% sensitive to tigacycline and colistin and 50% to amikacin. Conclusion: The incidence was higher for gram-positive bacteria. There is a good sensitivity to vancomycin, linezolid and tigacycline for gram-positive bacteria; and to amikacin, colistin and tigacillin for Gram-negatives. The multi-resistant KPC bacteria were only sensitive to tigecycline and colistin.

Estudio epidemiológico, descriptivo, multicéntrico, transversal, comparativo entre dos cohortes de recién nacidos a término y recién nacidos pretérmino, usando biometría hemática, proteína c reactiva, procalcitonina y hemocultivo para la identificación de los biomarcadores de sepsis neonatal / Epidemiological, descriptive, multicenter, cross-sectional, comparative study between two cohorts of term infants and preterm infants, using blood count, c-reactive protein, procalcitonin and blood culture for the identification of neonatal sepsis biomarkers

Antecedente: el diagnóstico de la sepsis neonatal se basa en parámetros clínicos y de laboratorio, siendo el hemocultivo el estándar de oro. El uso de biomarcadores ­como la procalcitonina, la proteína C reactiva y otros complementarios, como el conteo de leucocitos­ podría contribuir al diagnóstico temprano de la sepsis neonatal. Propósito: comparar el uso de la proteína C reactiva, la procalcitonina, el conteo de leucocitos y el hemocultivo entre los recién nacidos a término y pretérmino para la identificación de los biomarcadores de la sepsis neonatal. Materiales y métodos: este es un estudio multicéntrico, descriptivo, transversal y prospectivo de cohortes, desarrollado en el Hospital Pediátrico Baca Ortiz y en el Hospital Ginecológico Obstétrico Isidro Ayora. Se analizarán 204 casos de neonatos pretérmino y a término, con factores de riesgo y alta sospecha clínica de sepsis neonatal, que fueron admitidos en el periodo de septiembre a diciembre del 2018, en quienes se evaluaron los diagnósticos complementarios tanto al ingreso como a las 72 horas de admisión. Se tomaron las variables demográficas, de morbilidad, operativas y de laboratorio. Se aplicó la estadística descriptiva con medidas de tendencia central e inferencial (chi-cuadrado y test U de Mann Whitney). Se diseñaron curvas ROC (Receiver Operating Characteristic), estableciendo sensibilidad, especificidad, valor predictivo positivo y valor predictivo negativo para los complementarios diagnósticos en relación con el estándar de oro. Resultados: el conteo de leucocitos presenta una sensibilidad de 29 %-23 %, una especificidad de 92 %-92 %, un valor predictivo positivo de 56 %-50 %, un valor predictivo negativo de 79 %-78 %. El conteo de neutrófilos indica una sensibilidad de 24 %-21 %, una especificidad de 93 %-93 %, un valor predictivo positivo de 52 %-50 %, un valor predictivo negativo de 78 %-77 %; el conteo de plaquetas mostró una sensibilidad de 62-71 %, 78-77 %, 48-51 % y 86-89 %; una cuantificación de PCR indicó una sensibilidad de 87-79 %, una especificidad de 63-73 %, un valor predictivo positivo de 44-50 % y un valor predictivo negativo de 93-91 %; la cuantificación de procalcitonina presentó un sensibilidad de 73-54 %, una especificidad 61-84 %, un valor predictivo positivo de 39-53 % y un valor predictivo negativo de 87-84 %. En todos los casos la cuantificación se realizó entre las 24 y las 72 horas de vida.

Background: The diagnosis of neonatal sepsis is based on clinical and laboratory parameters, blood culture being the gold standard. The use of biomarkers such as procalcitonin and C-reactive protein and complementary tests such as leukocyte count could contribute to the early diagnosis of neonatal sepsis. Aim: To compare the use of C-reactive protein, procalcitonin, leukocyte count and blood culture between term and preterm infants for the identification of biomarkers of neonatal sepsis. Materials and Methods: This is a prospective, cross-sectional multicenter descriptive study of cohorts, donne at the Baca Ortiz Pediatric Hospital and Gynecological Obstetric Hospital Isidro Ayora. 204 cases of preterm and term neonates were analyzed, these neonates had risk factors and high clinical suspicion of neonatal sepsis and were admitted to the above mentioned hospitals in the period from September to December 2018, and who were evaluated at admission and at 72 hours of admission. Demographic, morbidity, operative and laboratory variables were taken. Descriptive statistics were applied with measures of central tendency, and inferential (Chi Square and Test U of Mann Whitney). ROC curves (Receiver Operating Characteristic) were designed, establishing sensitivity, specificity, positive predictive value, negative predictive value for complementary diagnoses in relation to the gold standard. Results: The leukocyte count has a sensitivity of 29 %, specificity 92 %, positive predictive value 56 %, negative predictive value 79 %, neutrophil count has a sensitivity of 24 %, specificity 93 %, positive predictive value of 52 %, negative predictive value 78 %, platelet count has a sensitivity of 62-71%, specificity 78 %, positive predictive value 48 %, negative predictive value 86 %, CRP measurement had a sensitivity 87 %, specificity 63 %, positive predictive value 39 %, negative predictive value 87 % and measurement of procalcitonin had a sensitivity 73 %, specificity 61 %, positive predictive value 39 %, negative predictive value 87 %. In all cases the measurements were done between 24 to 72 hours of life.

Caracterización de pacientes pediatricos con hemocultivos positivos del servicio de cuidado intensivo pediatrico del Hospital San José Bogotá, abril 2012 a 2017 / Description of Pediatric Patients with Positive Blood Cultures from the Pediatric Intensive Care Unit at Hospital de San José in Bogotá, April 2012 to 2017

Introducción: El cultivo de la sangre es el método más utilizado en la búsqueda de infecciones del paciente pediátrico porque orienta la terapia antimicrobiana. Objetivo: Determinar la incidencia de hemocultivos positivos y su caracterización microbiológica en pacientes de cuidado intensivo pediátrico del Hospital de San José, Bogotá-Colombia. Materiales y métodos: Descripción de hemocultivos positivos en pacientes pediátricos de la unidad desde abril de 2012 a 2017. Se determinó la incidencia de hemocultivos positivos y se describió la población estudiada y los gérmenes aislados incluido su perfl de antibiograma. Resultados: Ingresaron 1773 pacientes a la UCIP, 241 pacientes (13,6%) fueron hemocultivados, de los cuales 80 (33,2%) fueron positivos, pero 50% de estos fueron catalogados como contaminaciones. La mediana de edad fue de 21 meses, con 64% de sexo masculino. El 57% fue ventilado y 45% tuvieron un catéter central. La mortalidad fue de 15,4%. La patología más frecuentemente fue respiratoria (75%). De los gérmenes no contaminantes el más frecuente aislado fue Staphylococcus aureus (30%), seguido de Klebsiella pneumoniae (17,5%) y Streptococcus pneumoniae (17,5%). El germen contaminante más frecuente fue Staphylococcus epidermidis (47,5%). Conclusión: La frecuencia de hemocultivos positivos es baja y es frecuente que se aíslen gérmenes contaminantes. El patrón fue similar a lo reportado por la red GREBO.

Introduction. Blood culture is the method most used in the search for pediatric infections because it guides the antimicrobial therapy. Objective. To determine the incidence of positive blood cultures and their microbiological characterization in patients of the pediatric intensive care service of San José Hospital, Bogotá-Colombia. Materials and methods: Description of positive blood cultures in pediatric patients of the unit from April 2012 to 2017. The incidence of positive blood cultures was determined and the population studied and the isolated germs were described, including their antibiogram profle. Results: 1773 patients were admitted to the PICU, 241 patients (13.6%) were blood cultures, of which 80 (33.2%) were positive, but 50% of these were classifed as contaminations. The median age was 21 months, with 64% male. 57% were ventilated and 45% had a central catheter. Mortality was 15.4%. The most frequent pathology was respiratory (75%). Of the non-polluting organisms, the most frequent isolate was Staphylococcus aureus (30%), followed by Klebsiella pneumoniae (17.5%) and Streptococcus pneumoniae (17.5%). The most frequent contaminant was Staphylococcus epidermidis (47.5%). Conclusion: The frequency of positive blood cultures is low and polluting organisms are often isolated. The pattern was similar to that reported by the GREBO network.

Bacteriemias en pacientes oncológicos del Instituto del Cáncer SOLCA. Cuenca, 2011-2016 / Bacteriemia in cancer patients at the SOLCA Cancer Institute. Cuenca, 2011-2016

Objetivo: caracterizar los episodios de bacteriemias, los microorganismos causantes y sus patrones de sensibilidad, en pacientes atendidos en el Instituto del Cáncer SOLCA ­ Cuenca, Ecuador. Metodología: se utilizó un diseño descriptivo. El estudio se enfocó en to-dos los episodios de bacteriemias ocurridos en el periodo 2011-2016 ve-rificados mediante hemocultivos. Las variables estudiadas fueron edad y sexo de los pacientes en los que se produjo la bacteriemia; tipo de tumor, microorganismo, tiempo de positivización y perfil de resistencia. Resultados: se identificaron 318 episodios. El 66.8% de los microorganis-mos aislados fueron bacterias gramnegativas y el 33.2% grampositivas; los más prevalentes fueron Escherichia coli 37.3%, Staphylococcus au-reus 17.9%, Klebsiella.spp 9.3%, Estafilococos coagulasa negativa 7.2% y Pseudomonas aeruginosa 5.1%. En los cocos grampositivos, la meticilino resistencia fue de 40% en Staphylococcus aureus.y 67% en Staphylococ-cus coagulasa negativa; Escherichia coli y Klebsiella pneumoniae fueron resistentes a cefalosporinas de tercera generación en un 29% y 47%, res-pectivamente, compatibles con el fenotipo de beta-lactamasa de espectro extendido; la resistencia a quinolonas fue 35% y 50% respectivamente. Conclusiones: las bacterias gramnegativas fueron los microorganismos más prevalentes en este estudio, principalmente enterobacterias, con una importante resistencia a los antibióticos ensayados.

Objective: to characterize the episodes of bacteremia, the causative microorganisms and their patterns of sensitivity in patients treated at the Cancer Institute SOLCA - Cuenca, Ecuador.Methodology: a descriptive design was applied. The study focused on all episodes of bacteremia occurred in the period 2011-2016, they were verified by blood cultures. The variables studied were age and sex of the patients in whom the bacteremia occurred; type of tumor, microorganism, time of positivization and resistance profile.Results: a total of 318 episodes were identified. The 66.8% of the isolated microorganisms were gram-negative bacteria and 33.2% gram-positive; the most prevalent were Escherichia coli 37.3%, Staphylococcus aureus 17.9%, Klebsiella.spp 9.3%, Staphylococcus coagulase negative 7.2% and Pseudomonasaeruginosa 5.1%. In gram-positive cocci, methicillin resistance was 40% in Staphylococcus.aureus and 67% in coagulase-negative Staphylococcus; Escherichia.coli and Klebsiella pneumoniae were resistant to third-generation cephalosporins by 29% and 47% respectively, compatible with the extended-spectrum beta-lactamase phenotype; the resistance to quinolones was 35% and 50% respectively.Conclusions: the gram-negative bacteria were the most prevalent microorganisms in this study, mainly the enterobacteria, with an important resistance to the antibiotics tested.

Incidencia y subregistro de casos de leptospirosis diagnosticados con tres métodos diferentes en Urabá, Colombia / Incidence and underreporting of leptospirosis comparing three diagnostic methods in the endemic region of Urabá, Colombia

Resumen Introducción. La leptospirosis representa un problema de salud pública y es una causa importante de morbimortalidad en la región de Urabá, cuya notificación se ve afectada por las deficiencias en el diagnóstico. Objetivo. Establecer la incidencia de la leptospirosis en los municipios del llamado 'eje bananero' de la región de Urabá, documentar la magnitud del subregistro y proponer orientaciones para el diagnóstico por laboratorio por parte de la red de salud pública. Materiales y métodos. Se compararon dos fuentes de información sobre la leptospirosis: el sistema oficial nacional de vigilancia y un estudio transversal de 479 pacientes febriles, llevado a cabo entre abril de 2010 y mayo de 2012. El diagnóstico se hizo con base en tres pruebas: inmunofluorescencia indirecta, microaglutinación y hemocultivo. La exhaustividad de cada fuente de información se estimó mediante el método de captura y recaptura. Resultados. El 58 % (278/479) de los pacientes fueron positivos para leptospirosis, por lo menos, en una de las pruebas y, el 10,43 % (29/278), en las tres. La inclusión de una cepa nativa en el panel de la prueba de microaglutinación aumentó el porcentaje de positividad en 15 %. La tasa acumulada de incidencia fue de 66,5 por 100.000 habitantes y la proporción de letalidad fue de 2,15 %. El subregistro de la morbilidad por leptospirosis en la región de Urabá, fue de 27,8 % y, el de la mortalidad, de 66,6 %. Conclusión. El subregistro de leptospirosis en la región reitera la necesidad de usar más de una prueba diagnóstica para identificar Leptospira spp. en pacientes de zonas endémicas. Este subregistro podría ser una situación común en todo el país.

Abstract Introduction: Leptospirosis represents a public health problem and is a significant cause of morbidity and mortality in the region of Urabá. However, its notification reveals diagnostic limitations. Objective: To establish the incidence of leptospirosis in the municipalities of the so-called eje bananero in the Urabá region, to describe the magnitude of underreporting, and to propose guidelines for laboratory diagnosis by the public health network. Materials and methods: Two leptospirosis information sources were used: The national official surveillance system and a cross-sectional study of 479 acute-phase patients from April, 2010, to May, 2012. The diagnosis was made using three different tests: Indirect immunofluorescence, microagglutination test, and blood cultures. The exhaustiveness percentage of each information source was calculatedusing thecapture and recapture test. Results: From the total number of cases, 58% (278/479) were positive for leptospirosis at least by a test and 10.43% (29/278) of cases were positive by all three methods. The inclusion of a native strain in the microagglutination test panel increased the percentage of positivity by 15%. The cumulative incidence rate was 66.5/100,000 inhabitants and the case fatality ratio was 2.15%. The underreporting rates of leptospirosis in the Urabá region were 27.8% in morbidity and 66.6% in mortality. Conclusion: Under-registration of leptospirosis in the region highlights the necessity to use more than one diagnostic test to identify Leptospira in patients from endemic areas. Under-registration could be a common situation throughout the country.